DC和NK细胞的lineage及marker基因

  1. NK细胞
  2. DC细胞

在分析单细胞RNA的时候,最为重要的就是细胞命名。细胞聚类最重要的方法之一,就是利用marker基因在不同细胞中的表达差异,来对细胞命名。本文就介绍NK细胞核DC细胞的lineage以及相应的cell marker

NK细胞

NK细胞的lineage:

transcription_bursting

NK 细胞由common lymphoid progenitors分化而来,经过多次分化后,形成NK细胞,ILC1, ILC2, ILC3, 以及LTi细胞,这些细胞相应的功能与cell marker:

sc.bias

除此之外,还存在另外一类细胞,叫NKT细胞,这一类细胞既有NK细胞的特征,也有T细胞的特征,但是一般把这一类细胞归类为T细胞。相关marerk为:

bias

DC细胞

DC细胞相对而言,比NK细胞要复杂的多:

bias

DC细胞一般是从骨髓中的HSC发育而来,更详细的lineage极其功能如下图所示:

bias

DC主要分为pDC, cDC1, cDC2,和mo-DC, 其中mo-DC是从单核细胞发育而来,而其他cDC1, cDC2是从pre-DC发育而来, pDC从CDP发育而来:如图所示:

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DC细胞的发育时非常复杂的,来源也很复杂,多种DC的前体细胞可以发育成同一种DC细胞,而多种DC细胞也可以是从同一种前体细胞中发育而来:

bias

关于DC的cell marker更加复杂:同一种DC细胞,但是在不同的组织中,其cell marker都有可能不一样:

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在这里,我列出一些主要的DC细胞类型的cell marker:

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目前这就是我总结的全部关于NK细胞以及DC细胞相关的内容。


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